Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms