Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms