Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms