Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP13-3Q3SY46 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms