Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCGF3Q3KNV8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms