Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms