Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms