Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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