Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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