Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
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