Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP4Q15650 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms