Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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