Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
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