Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRKQ15262 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms