Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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PTPAQ15257 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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