Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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