Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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