Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms