Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms