Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
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