Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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UBE4AQ14139 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
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UBE4AQ14139 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
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UBE4AQ14139 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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UBE4AQ14139 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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UBE4AQ14139 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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UBE4AQ14139 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
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UBE4AQ14139 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
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UBE4AQ14139 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
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UBE4AQ14139 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
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UBE4AQ14139 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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UBE4AQ14139 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
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