Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PDE6HQ13956 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PDE6HQ13956 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PDE6HQ13956 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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PDE6HQ13956 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PDE6HQ13956 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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