Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOFQ13790 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOFQ13790 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOFQ13790 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOFQ13790 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOFQ13790 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOFQ13790 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOFQ13790 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOFQ13790 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOFQ13790 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOFQ13790 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOFQ13790 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOFQ13790 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOFQ13790 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOFQ13790 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOFQ13790 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOFQ13790 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOFQ13790 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOFQ13790 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOFQ13790 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOFQ13790 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOFQ13790 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOFQ13790 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOFQ13790 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOFQ13790 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOFQ13790 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOFQ13790 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOFQ13790 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOFQ13790 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOFQ13790 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOFQ13790 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOFQ13790 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOFQ13790 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOFQ13790 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOFQ13790 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOFQ13790 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOFQ13790 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOFQ13790 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOFQ13790 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOFQ13790 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOFQ13790 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOFQ13790 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOFQ13790 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOFQ13790 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOFQ13790 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOFQ13790 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOFQ13790 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOFQ13790 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOFQ13790 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOFQ13790 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOFQ13790 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOFQ13790 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOFQ13790 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOFQ13790 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOFQ13790 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOFQ13790 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOFQ13790 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOFQ13790 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOFQ13790 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOFQ13790 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOFQ13790 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOFQ13790 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOFQ13790 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOFQ13790 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOFQ13790 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOFQ13790 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOFQ13790 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOFQ13790 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOFQ13790 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOFQ13790 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOFQ13790 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOFQ13790 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOFQ13790 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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