Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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