Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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