Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
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