Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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