Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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KCNMA1Q12791 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
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KCNMA1Q12791 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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KCNMA1Q12791 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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KCNMA1Q12791 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMA1Q12791 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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