Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC31.95■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms