Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms