Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms