Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms