Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms