Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAV1Q03135 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms