Protein–RNA interactions for Protein: Q02985

CFHR3, Complement factor H-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR3Q02985 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR3Q02985 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms