Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms