Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPCQ01831 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPCQ01831 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
XPCQ01831 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPCQ01831 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
XPCQ01831 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
XPCQ01831 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPCQ01831 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPCQ01831 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPCQ01831 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPCQ01831 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPCQ01831 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPCQ01831 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPCQ01831 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPCQ01831 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPCQ01831 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPCQ01831 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPCQ01831 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPCQ01831 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XPCQ01831 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XPCQ01831 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XPCQ01831 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
XPCQ01831 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
XPCQ01831 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
XPCQ01831 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
XPCQ01831 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XPCQ01831 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
XPCQ01831 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XPCQ01831 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XPCQ01831 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPCQ01831 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPCQ01831 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPCQ01831 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPCQ01831 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPCQ01831 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPCQ01831 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPCQ01831 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPCQ01831 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPCQ01831 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPCQ01831 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPCQ01831 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPCQ01831 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPCQ01831 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPCQ01831 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPCQ01831 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
XPCQ01831 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
XPCQ01831 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPCQ01831 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPCQ01831 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPCQ01831 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPCQ01831 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPCQ01831 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPCQ01831 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPCQ01831 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPCQ01831 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPCQ01831 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPCQ01831 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPCQ01831 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPCQ01831 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPCQ01831 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPCQ01831 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPCQ01831 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPCQ01831 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPCQ01831 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
XPCQ01831 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPCQ01831 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
XPCQ01831 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XPCQ01831 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XPCQ01831 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XPCQ01831 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XPCQ01831 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XPCQ01831 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
XPCQ01831 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
XPCQ01831 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
XPCQ01831 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
XPCQ01831 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
XPCQ01831 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPCQ01831 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPCQ01831 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPCQ01831 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPCQ01831 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPCQ01831 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPCQ01831 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPCQ01831 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPCQ01831 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPCQ01831 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPCQ01831 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPCQ01831 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPCQ01831 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPCQ01831 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPCQ01831 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPCQ01831 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPCQ01831 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPCQ01831 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPCQ01831 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPCQ01831 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPCQ01831 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPCQ01831 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPCQ01831 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPCQ01831 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms