Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms