Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms