Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms