Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS9P82933 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms