Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRB1P82279 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRB1P82279 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRB1P82279 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRB1P82279 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CRB1P82279 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRB1P82279 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRB1P82279 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRB1P82279 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRB1P82279 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRB1P82279 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRB1P82279 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRB1P82279 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRB1P82279 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRB1P82279 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRB1P82279 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRB1P82279 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRB1P82279 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRB1P82279 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRB1P82279 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRB1P82279 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRB1P82279 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRB1P82279 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRB1P82279 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRB1P82279 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRB1P82279 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRB1P82279 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRB1P82279 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRB1P82279 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRB1P82279 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRB1P82279 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRB1P82279 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRB1P82279 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB1P82279 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRB1P82279 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CRB1P82279 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CRB1P82279 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRB1P82279 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRB1P82279 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRB1P82279 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRB1P82279 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRB1P82279 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRB1P82279 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRB1P82279 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRB1P82279 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRB1P82279 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CRB1P82279 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CRB1P82279 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CRB1P82279 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRB1P82279 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRB1P82279 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRB1P82279 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRB1P82279 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRB1P82279 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRB1P82279 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRB1P82279 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRB1P82279 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRB1P82279 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRB1P82279 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRB1P82279 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRB1P82279 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRB1P82279 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRB1P82279 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRB1P82279 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRB1P82279 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRB1P82279 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CRB1P82279 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CRB1P82279 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CRB1P82279 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRB1P82279 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRB1P82279 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CRB1P82279 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRB1P82279 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms