Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms