Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM4P67936 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM4P67936 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM4P67936 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM4P67936 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM4P67936 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM4P67936 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM4P67936 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM4P67936 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM4P67936 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM4P67936 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM4P67936 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM4P67936 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TPM4P67936 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TPM4P67936 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPM4P67936 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TPM4P67936 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TPM4P67936 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TPM4P67936 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPM4P67936 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TPM4P67936 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPM4P67936 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPM4P67936 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPM4P67936 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPM4P67936 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM4P67936 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM4P67936 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM4P67936 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM4P67936 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM4P67936 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM4P67936 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM4P67936 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM4P67936 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM4P67936 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM4P67936 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM4P67936 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM4P67936 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM4P67936 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM4P67936 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM4P67936 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM4P67936 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM4P67936 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM4P67936 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM4P67936 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM4P67936 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM4P67936 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM4P67936 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM4P67936 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM4P67936 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM4P67936 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM4P67936 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM4P67936 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM4P67936 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM4P67936 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM4P67936 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM4P67936 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM4P67936 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM4P67936 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM4P67936 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM4P67936 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM4P67936 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM4P67936 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM4P67936 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM4P67936 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM4P67936 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM4P67936 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM4P67936 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM4P67936 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM4P67936 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM4P67936 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM4P67936 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM4P67936 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM4P67936 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM4P67936 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms