Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms