Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF6P62330 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF6P62330 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF6P62330 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms