Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2FP61218 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2FP61218 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2FP61218 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2FP61218 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POLR2FP61218 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2FP61218 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2FP61218 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2FP61218 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2FP61218 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2FP61218 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2FP61218 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2FP61218 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2FP61218 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2FP61218 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2FP61218 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms