Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms