Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms