Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF3P57682 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF3P57682 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF3P57682 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF3P57682 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF3P57682 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF3P57682 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF3P57682 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF3P57682 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLF3P57682 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF3P57682 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF3P57682 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF3P57682 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF3P57682 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF3P57682 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF3P57682 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF3P57682 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF3P57682 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF3P57682 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF3P57682 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF3P57682 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF3P57682 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF3P57682 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF3P57682 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF3P57682 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF3P57682 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF3P57682 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF3P57682 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF3P57682 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF3P57682 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF3P57682 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF3P57682 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF3P57682 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms